氨基酸連接鍵主要是肽鍵。

氨基酸是構(gòu)成蛋白質(zhì)的基本單位，在生物體中，氨基酸之間通過特定的化學(xué)鍵相互連接形成多肽鏈，進(jìn)而折疊、盤繞形成具有復(fù)雜空間結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)。肽鍵是一個氨基酸的α - 羧基（ - COOH）與另一個氨基酸的α - 氨基（ - NH?）脫水縮合所形成的化學(xué)鍵，其化學(xué)結(jié)構(gòu)為 - CO - NH - 。

從反應(yīng)過程來看，當(dāng)一個氨基酸的羧基中的羥基（ - OH）和另一個氨基酸氨基中的氫原子（ - H）結(jié)合生成一分子水，然后羧基的碳和氨基的氮相連，就形成了肽鍵。這種連接方式使得氨基酸能夠依次相連，形成肽鏈。由兩個氨基酸通過肽鍵相連形成的化合物稱為二肽，多個氨基酸通過肽鍵依次相連就形成了多肽。

肽鍵具有一些重要的性質(zhì)。它具有部分雙鍵的性質(zhì)，不能自由旋轉(zhuǎn)，這對于多肽鏈和蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)形成有著重要影響。肽鍵是蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的主要連接方式，而蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)又決定了其高級結(jié)構(gòu)和功能。此外，肽鍵在一定條件下可以被水解，比如在酸、堿或蛋白酶的作用下，肽鍵斷裂，蛋白質(zhì)或多肽就會分解為氨基酸或小肽片段。

除了肽鍵外，在蛋白質(zhì)分子中，氨基酸殘基之間還存在其他的相互作用和連接方式。例如，二硫鍵是由兩個半胱氨酸殘基的巰基（ - SH）氧化形成的，它可以在不同的肽鏈之間或同一肽鏈的不同部位之間形成交聯(lián)，對維持蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性起著重要作用。另外，還有氫鍵、離子鍵、疏水相互作用等非共價鍵，它們共同參與蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的形成和穩(wěn)定，使得蛋白質(zhì)能夠具有特定的生物學(xué)功能。但從氨基酸直接連接成鏈狀結(jié)構(gòu)的角度來說，肽鍵是最關(guān)鍵的連接鍵。