清除非藥用部位具有多方面重要目的，具體如下：

首先是保證用藥劑量的準(zhǔn)確性。中藥材中常常包含一些非藥用部分，如果不加以清除，在稱量藥材時就會使非藥用物質(zhì)也被計入重量，從而導(dǎo)致實際藥用成分的含量不足。例如，麻黃的根與莖作用不同，莖能發(fā)汗解表，根則止汗，若不將根去除干凈，會影響麻黃發(fā)汗功效的準(zhǔn)確發(fā)揮，也難以按照準(zhǔn)確劑量為患者用藥，進(jìn)而影響治療效果。

其次是提高藥物的純度和療效。非藥用部位可能會干擾藥用成分的提取和藥效的發(fā)揮。像遠(yuǎn)志，其心部不僅無明顯藥效，還可能影響遠(yuǎn)志祛痰、安神等功效的發(fā)揮，去除心部后能使有效成分更集中，提高藥物純度，讓藥物更好地發(fā)揮治療作用。

再者是有利于制劑的制備。在中藥制劑生產(chǎn)過程中，非藥用部位可能會影響制劑的質(zhì)量和穩(wěn)定性。比如，果實類藥材表面的絨毛、雜質(zhì)等，若不清除，可能會堵塞生產(chǎn)設(shè)備，影響制劑的澄清度和均勻度。清除這些非藥用部位可以保證制劑生產(chǎn)的順利進(jìn)行，提高制劑的質(zhì)量。

然后是保證用藥安全。部分非藥用部位可能存在毒性或不良反應(yīng)。如白果的芯含有少量氫氰酸，有一定毒性，去除芯后能降低用藥風(fēng)險，保障患者用藥安全。

最后是便于儲存和保管。非藥用部位往往含有較多的水分、雜質(zhì)等，容易導(dǎo)致藥材發(fā)霉、變質(zhì)。清除非藥用部位可以減少這些不利因素，延長藥材的儲存時間，保證藥材質(zhì)量的穩(wěn)定。總之，清除非藥用部位是中藥炮制過程中不可或缺的重要環(huán)節(jié)，對保證中藥的質(zhì)量、療效和安全具有重要意義。