激光共聚焦掃描顯微鏡可改變觀察的焦平面，因而能進行“光學切片”，觀察較厚樣品的內部結構。將改變焦點獲得的一系列細胞不同平面上的圖像疊加后，可重構出樣品的三維結構。

　　激光共聚焦掃描顯微鏡既可以用于觀察細胞形態(tài)，醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理也可以用于細胞內生化成分的定量分析、光密度統(tǒng)計以及細胞形態(tài)的測量。